Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLRC4Q9NPP4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLRC4Q9NPP4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLRC4Q9NPP4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms