Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUFT1Q9NNX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUFT1Q9NNX1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms