Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CLSPNQ9HAW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CLSPNQ9HAW4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CLSPNQ9HAW4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms