Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WDR41Q9HAD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WDR41Q9HAD4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms