Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VIPAS39Q9H9C1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VIPAS39Q9H9C1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms