Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNCQ9H7C4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNCQ9H7C4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYNCQ9H7C4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms