Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOJQ9H4E5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOJQ9H4E5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms