Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM49AQ9H0Q0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM49AQ9H0Q0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM49AQ9H0Q0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms