Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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LRRC27Q9C0I9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC27Q9C0I9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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