Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZYG11BQ9C0D3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZYG11BQ9C0D3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZYG11BQ9C0D3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZYG11BQ9C0D3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZYG11BQ9C0D3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZYG11BQ9C0D3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZYG11BQ9C0D3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZYG11BQ9C0D3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms