Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPS2Q9BXY5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPS2Q9BXY5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPS2Q9BXY5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms