Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TDRD1Q9BXT4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD1Q9BXT4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDRD1Q9BXT4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms