Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SALL3Q9BXA9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SALL3Q9BXA9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms