Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SSBP4Q9BWG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms