Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HIGD2AQ9BW72 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HIGD2AQ9BW72 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HIGD2AQ9BW72 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HIGD2AQ9BW72 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HIGD2AQ9BW72 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms