Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNDC11Q9BVV2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FNDC11Q9BVV2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms