Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KATNB1Q9BVA0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
KATNB1Q9BVA0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms