Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
THUMPD2Q9BTF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
THUMPD2Q9BTF0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms