Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UPK3BQ9BT76 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms