Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms