Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGME1Q9BQP7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MGME1Q9BQP7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms