Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGIP1Q9BQI5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SGIP1Q9BQI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms