Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A12Q96S37 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A12Q96S37 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A12Q96S37 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC22A12Q96S37 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC22A12Q96S37 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A12Q96S37 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms