Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC85AQ96PX6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC85AQ96PX6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC85AQ96PX6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms