Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC115Q96NT0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC115Q96NT0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC115Q96NT0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms