Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C8orf49Q96NF6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C8orf49Q96NF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms