Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RILPQ96NA2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RILPQ96NA2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RILPQ96NA2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms