Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP4Q96MN2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP4Q96MN2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP4Q96MN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms