Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC7Q96M83 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC7Q96M83 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms