Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87BQ96K49 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM87BQ96K49 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM87BQ96K49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 503.4 ms