Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CDHR1Q96JP9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDHR1Q96JP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR1Q96JP9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDHR1Q96JP9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR1Q96JP9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR1Q96JP9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR1Q96JP9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDHR1Q96JP9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms