Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGED4Q96JG8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGED4Q96JG8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms