Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RNF185Q96GF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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RNF185Q96GF1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RNF185Q96GF1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RNF185Q96GF1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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