Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIPA1Q96FS4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIPA1Q96FS4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1Q96FS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms