Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
L3HYPDHQ96EM0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
L3HYPDHQ96EM0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
L3HYPDHQ96EM0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms