Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTP4Q96DX8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms