Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC74AQ96AQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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