Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FUBP1Q96AE4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FUBP1Q96AE4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms