Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM52Q96A61 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM52Q96A61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM52Q96A61 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms