Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RFX1-207ENST00000589937 540 ntTSL 412.23□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 BCAS3-211ENST00000587002 550 ntTSL 312.23□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZFAT-201ENST00000377838 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ITPR1-206ENST00000463980 2215 ntTSL 212.21□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 POLR2C-207ENST00000564651 720 ntTSL 212.17□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZFAT-208ENST00000520356 4273 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RSRC2-213ENST00000527461 711 ntTSL 312.15□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 COG2-203ENST00000468893 2784 ntTSL 212.08□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 POLR2C-203ENST00000562953 806 ntTSL 212.05□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TSTD2-201ENST00000341170 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZFAT-207ENST00000520214 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PDK3-202ENST00000441463 1921 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NARS2-207ENST00000529880 755 ntTSL 311.94□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM133B-203ENST00000438306 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RSRC2-210ENST00000526560 545 ntTSL 411.84□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 HCN3-204ENST00000496230 3245 ntTSL 211.78□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 PRKD3-203ENST00000443187 695 ntTSL 410.87□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZFAT-216ENST00000523399 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.673e-8■■■■■ 70.6
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TBRG4Q969Z0 MLH1-205ENST00000432299 928 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KCNAB2-218ENST00000493807 560 ntTSL 310.8□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 GRSF1-207ENST00000514161 1765 ntTSL 210.75□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 WDR20-216ENST00000558567 586 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZDHHC14-207ENST00000518214 861 ntTSL 310.67□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RMDN1-217ENST00000523370 543 ntTSL 410.66□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DDB1-221ENST00000543162 575 ntTSL 410.64□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 BCAS3-203ENST00000408905 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PCID2-207ENST00000462653 669 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.722e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM60A-201ENST00000337682 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.723e-11■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 GGACT-206ENST00000492399 498 ntTSL 210.53□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DDB1-214ENST00000539426 805 ntTSL 310.5□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 LRRTM4-206ENST00000456154 485 ntTSL 410.49□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZNF133-207ENST00000425686 637 ntTSL 310.45□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PGAP3-209ENST00000584620 804 ntTSL 310.42□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SCMH1-209ENST00000397174 2977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TRAK1-204ENST00000418790 489 ntTSL 410.39□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SUOX-215ENST00000552258 543 ntTSL 410.39□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 70.6
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