Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAVIN3Q969G5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAVIN3Q969G5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms