Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
APH1BQ8WW43 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APH1BQ8WW43 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms