Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKA2Q8WVK7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKA2Q8WVK7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms