Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1Q8TAE8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1Q8TAE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GADD45GIP1Q8TAE8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GADD45GIP1Q8TAE8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms