Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYRIPQ8NFW9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYRIPQ8NFW9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms