Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BBOF1Q8ND07 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms