Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF169Q8NCN4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF169Q8NCN4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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