Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71DQ8N9W8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71DQ8N9W8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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