Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZIC4Q8N9L1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZIC4Q8N9L1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms