Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA1Q8N8W4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA1Q8N8W4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA1Q8N8W4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms